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Segundo o Ministério da Saúde, normalmente a maior incidência da dengue ocorre em abril ou maio e a redução dos casos é percebida a partir de junho. No entanto, em 2016 todo o processo foi percebido mais cedo, fevereiro teve o maior número de casos e em março houve tendência da redução.
Depois que o governo brasileiro confirmou a relação entre o vírus Zika em gestantes e o nascimento de bebês com microcefalia, em janeiro de 2016, o Ministério da Saúde intensificou a busca ativa por larvas do mosquito vetor da doença, o Aedes aegypti, que transmite também a dengue e a febre chikungunya. Segundo a pasta, esta ação foi um dos fatores que barraram a tendência de aumento dos casos em março e abril.